如何保证出货数量正确问题

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各位好，我有一个问题，想请大家帮忙看看有没有解决方法，在此谢过。

我们公司的产品发货时，有时会存在零头，比如，标准包装是10PCS/箱，客户订单为15PCS,这样，发货就是１个整箱和一个零头箱。
或者发货数量很少，比如就5PCS，或更少的数量。我们要求检验出货时零头箱和小于５PCS 发货数量时是需要全检数量的。
但有时，客户就会投诉我们说我们少发货，说是我们零头箱里少，或者就是数量少。
我们最近就遇到一个客户订单，一共就发2pcs，下的生产计划也就是２ＰＣＳ。
可是客户就说我们少了１ＰＣＳ，但我们出货记录都显示我们全检验了数量为２pcs,
但我们又没有什么有力的证据（比如图片什么的），只是有相应的检验记录。我们查了生产，过程检验记录都是２pcs.
反正不可能是我们的问题。
不知道有没有负责出货的同仁，你们公司采取什么方式保证发货的数量准确性？
当有数量少的投诉时，如果证明我们没有少发货？（有的客户明明自己的问题，却硬说是我们少发，想让我们免费补偿）